Горбунов С.В. Археологические памятники острова Монерон / С. В. Горбунов, М. М. Прокофьев ; Сахалинский областной краеведческий музей, Центр документации новейшей истории. - Южно-Сахалинск, 1994. - 69 с. - (Памяти Кимура Синроку и Ито Нобуо - первых исследователей археологии острова Монерон посвящается)

Проблемы этнической антропологии,археологии и этнографии айнов. Ч. 1: О месте айнов в системе рассовой классификации народов мира / А. П. Кондратенко, М. М. Прокофьев ; отв. ред. С. А. Арутюнов ; Академия наук СССР, Дальневосточное отделение, Институт Морской геологии и геофизики ; Сахалинское отделение всероссийского фонда культуры ; Общество изучения Сахалина и Курильских островов. - Препринт. - Южно-Сахалинск : ИМГиГ ДВО АН СССР, 1989. - 51 с.

Проблемы этнической антропологии,археологии и этнографии айнов. Ч. 2: Айны, тунгусо-маньчжуры и тончи : (археолого-этнографические параллели) / А. П. Кондратенко, М. М. Прокофьев ; отв. ред. С. А. Арутюнов ; Академия наук СССР, Дальневосточное отделение, Институт Морской геологии и геофизики ; Сахалинское отделение всероссийского фонда культуры ; Общество изучения Сахалина и Курильских островов. - Препринт. - Южно-Сахалинск : ИМГиГ ДВО АН СССР, 1989. - 48 с. : табл.

Проблемы этнической антропологии,археологии и этнографии айнов. Ч. 3: Алеуты и айны / А. П. Кондратенко, М. М. Прокофьев ; отв. ред. С. А. Арутюнов ; Академия наук СССР, Дальневосточное отделение, Институт Морской геологии и геофизики ; Сахалинское отделение всероссийского фонда культуры ; Общество изучения Сахалина и Курильских островов. - Препринт. - Южно-Сахалинск : ИМГиГ ДВО АН СССР, 1989. - 40 с. : табл.

Проблемы этнической антропологии,археологии и этнографии айнов. Ч. 4: Палеотихоокеанские культурные контакты / А. П. Кондратенко, М. М. Прокофьев ; отв. ред. С. А. Арутюнов ; Академия наук СССР, Дальневосточное отделение, Институт Морской геологии и геофизики ; Сахалинское отделение всероссийского фонда культуры ; Общество изучения Сахалина и Курильских островов. - Препринт. - Южно-Сахалинск : ИМГиГ ДВО АН СССР, 1989. - 50 с. : табл.

Назаренко, Ольга Федоровна. Тайны Сахалина. Белый остров / Ольга Назаренко ; [ред. М. Прокофьев]. - Южно-Сахалинск : Сахалин. кн. изд-во, 2007. - 230, [2] c. : цв. ил., цв. портр.

Островский А. Б. Религиозные верования нивхов / Александр Островский ; [науч. ред. В. М. Латышев, М. М. Прокофьев]. - Южно-Сахалинск : Сахалин.кн.изд-во, 2005. - 175, [1] с., [9] л. ил. : табл

Михаил Михайлович Прокофьев [Текст: Электронная копия] : библиографический указатель / Сахалинская областная универсальная научная библиотека, Отдел краеведения ; сост. А. В. Боронец ; ред. Т. Б. Хлусович. - Компьютерный файл (1 файл). - (Деятели Сахалинской области ; вып. 16) Бумажная версия не издавалась.

Сем Ю. А. Леопольд Иванович Шренк (1826 - 1894 гг.) : жизнь и деятельность исследователя Приамурья, Приморья и Сахалина / Ю. А. Сем ; [науч. ред. М. М. Прокофьев]. - Южно-Сахалинск : Ин-т наследия Бронислава Пилсудского : Сахалин. кн. изд-во, 2003. - 123, [1] с. : ил.

Штернберг, Лев Яковлевич. По Сахалину и Амуру: дневники путешествий, письма (1889 - 1927 гг.) / Л. Я. Штернберг ; сост.: М. М. Прокофьев, Г. И. Дударец ; науч. ред. В. М. Латышев ; Министерство культуры и архивного дела Сахалинской области, Государственное бюджетное учреждение культуры "Сахалинский областной краеведческий музей". - Белгород : КОНСТАНТА ; Южно-Сахалинск : ГБУК "Сахалинский областной краеведческий музей", 2019. - 305 с., [8] л. ил., портр., факс., карты : ил. ; 23 см. - (Библиотека Сахалинского музея)